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北京協和醫(yī)學院、中國醫(yī)學科學院（簡稱院校）實行院校合一的管理體制，相互依托，優(yōu)勢互補，教研相長。她面向全國，承擔著科研、教學、醫(yī)療三大任務。

北京協和醫(yī)學院研究生院現下設綜合辦公室、招生辦公室、培養(yǎng)辦公室和學位與學科建設辦公室；同時，依托分布在全國6省（市）的29個研究生培養(yǎng)單位（19個所屬單位及10個單位），形成了院校——所院兩級系統完整的多層次多類型的人才培養(yǎng)體系。目前，普通全日制在校研究生達3100余人。20多年來，協和畢業(yè)研究生達13000余人，授予碩士學位5400余人、博士學位4600余人，他們?yōu)閲裔t(yī)藥衛(wèi)生、科技和教育事業(yè)的發(fā)展做出了重要貢獻。

院校研究生教育學科門類齊全，綜合優(yōu)勢顯著。覆蓋理學、工學、醫(yī)學、管理學和哲學5個學科門類，培養(yǎng)研究生的研究領域包括基礎醫(yī)學，臨床醫(yī)學，生物學，藥學，公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學，中西醫(yī)結合，口腔醫(yī)學，公共管理，生物醫(yī)學工程，圖書館、情報與檔案管理，科學技術與哲學等。截至2009年12月，院校設有6個博士后科研流動站，已獲得生物學、基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、藥學、生物醫(yī)學工程、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學和中西醫(yī)結合7個一級學科博士學位授權點；一級學科國家重點學科2個、二級學科國家重點學科8個、三級學科國家重點學科2個、國家重點培育學科1個；一級學科北京市重點學科1個、二級學科北京市重點學科3個、三級學科北京市重點學科1個；擁有260多個實驗室，其中國家實驗室1個（籌）、國家重點實驗室4個、部委級重點實驗室10個；藏書超過86萬冊，期刊5700余種，被定為國家中心圖書館和國家科技圖書文獻中心醫(yī)學分中心。院校研究生教育依托院校資源辦學，優(yōu)良的科研設施設備、大量的前沿課題項目、充足的科研經費、雄厚的實踐基地、豐富的圖書文獻資源、的導師隊伍及廣泛的國際合作交流等，為研究生開展學術研究、參與課題實踐、鍛煉創(chuàng)新能力提供了強大的支撐和保障。

院校師資力量雄厚，擁有一大批在醫(yī)藥衛(wèi)生領域經驗豐富、學術水平較高并做出杰出貢獻的專家、教授?，F有兩院院士24人，其中中國科學院院士10人，中國工程院院士15人（1人為兩院院士）；國務院學位委員會委員1人、學科評議組成員9人（其中3人為學科評議組組長）；博士生導師370余人，碩士生導師630余人；教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授、講座教授14人，省部委級以上有突出貢獻的中青年專家90人；新世紀百千萬人才工程國家人選30余人，享受國務院政府特殊津貼專家630余人；高級專業(yè)技術職務人員1600多人。

研究生院將秉承“嚴謹、博精、創(chuàng)新、奉獻”的校訓，按照“高層次、研究型、國際化、有特色”的辦學要求，承擔起培養(yǎng)的醫(yī)學人才、提供科研成果和的醫(yī)療服務的重任，為實現把院校建設成為國際知名、國內的醫(yī)學科學中心和研究型大學的目標而努力奮斗。

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