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當細胞懸液形成液流柱流經流動室，由于振動形成液滴。被設定了分選參數(shù)的細胞的會被充電而帶有電荷，未被設定分選參數(shù)的細胞及空白液滴不帶電荷。帶電荷的液滴在落入電極偏轉板的高壓靜電場時，依所帶電荷是正或是負而發(fā)生向右或向左偏轉，落入指定的收集器中，完成細胞分選的目的。

1.分選速度：至少達5000個/秒左右。

2.分選純度　與儀器的精密度直接相關，同時與被分選細胞與細胞懸液中其他細胞有無相互重疊的生物學特性密切相關。

3.分選收獲率　是指設定通過測量點的分選細胞與實際收獲的分選細胞之間的比率。收獲率的高低與被分選細胞和不選細胞間的生物學特性是否重疊有關。當被要求分選的細胞純度高，收獲率相對低。

4.分選得率：是指從一群體細胞懸液中分辨出目的細胞的總量，再經分選后獲得目的細胞的實際得率。該得率與分選的速度密切相關，當分選速度過高，會使部分目的細胞漏檢，使得率下降；分選速度降低，目的細胞信號被檢時間增加，得率增加。

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