中醫(yī)藥重點學科中醫(yī)基礎(chǔ)理論：

上海中醫(yī)藥大學中醫(yī)基礎(chǔ)理論重點學科成立于1990年，在上世紀90年代初先后作為上海市重點學科和國家中醫(yī)藥管理局重點學科建設(shè)，2002年再次作為國家中醫(yī)藥管理局重點學科建設(shè)，使學科得到了長足的發(fā)展。本學科由“中醫(yī)基礎(chǔ)理論”、“內(nèi)經(jīng)”和“實驗中醫(yī)學”3個教研室構(gòu)成核心科室，中醫(yī)診斷教研室、文獻研究所、教學實驗中心、科研實驗中心等多個科室、部門部分教師參加。學科設(shè)有“中醫(yī)藥細胞與分子生物學實驗室”，該實驗室于2003年通過中管局三級實驗室審查、核準，正式掛牌。

學科帶頭人方肇勤教授，博導，上海中醫(yī)藥學會中醫(yī)基礎(chǔ)學分會主任委員。學術(shù)帶頭人王慶其教授，博導，上海市名中醫(yī)，中國中醫(yī)藥學會內(nèi)經(jīng)專業(yè)委員會副主任，全國中醫(yī)藥學位與研究生教育研究會副理事長，上海市中醫(yī)藥學會內(nèi)科專業(yè)委員會副主任，上海中醫(yī)藥大學學術(shù)委員會秘書長。學科后備專家陳曉博士，副教授，上海中醫(yī)藥大學基礎(chǔ)醫(yī)學院副院長，上海中醫(yī)藥學會中醫(yī)基礎(chǔ)學分會秘書。學科成員26人。其中教授10人，副教授7人，講師5人，主管技師1人，助教3人；博導7人、碩導7人。平均年齡40.73歲。其中博士學位7人，碩士學位17人，學士學位1人。學科還榮獲上海市優(yōu)秀教育工作者（2001年）1人次和上海中醫(yī)藥大學首屆師德標兵（2004年）1人次。

多年來，學科形成了穩(wěn)定的研究方向。主要包括：證和辨證論治基礎(chǔ)研究（包括證和辨證論治基后因組學研究、證和辨證論治實驗動物四診標準化及其機制研究、辨證客觀化和標準化、證和辨證論治文獻學研究等）、心身醫(yī)學研究、藏象理論研究和內(nèi)經(jīng)理論與實踐研究。2002年以來，學科負責的在研和新獲得資助科研項目計37項，經(jīng)費346.3萬元，其中國家級5項、市部級11項、局級19項、校級1項、學科1項。參與合作的課題共15項，經(jīng)費130.8萬，其中國家級5項、市部級4項、局級5項、校級1項。此外，還有4項橫向科研項目，經(jīng)費69萬，其中國家級1項、校級1項、企業(yè)1項。以上共計56項，經(jīng)費489.70萬元。圍繞本學科的研究方向，項目涉及：不同疾病、以及體質(zhì)的中醫(yī)證的特征及其演變的流行病學調(diào)查；不同疾病辨證論治機理的實驗研究；實驗小鼠四診客觀化、標準化的研究和辨證論治標準化及其機理研究；部分發(fā)展型項目如二仙湯等有效中藥制劑的開發(fā)；辨證論治等文獻研究等。一些課題達到了國內(nèi)領(lǐng)先水平，研究思路、方法和成果有所創(chuàng)新。例如與美國合作的研究，首次在國際上大通量地觀察到大鼠肝癌誘發(fā)過程中基因表達的差異、不同中醫(yī)治法的調(diào)整異同，其中大多表達改變顯著的基因國際上尚未得到其全部序列，大多已知基因以往研究也未涉及到肝癌；在國際上首先篩選和克隆的大鼠完整表達基因“ Rattus norvegicus DD31 gene”，實現(xiàn)GenBank登錄；在芯片檢測的基礎(chǔ)上，正積極對那些中醫(yī)不同治法選擇性調(diào)節(jié)的EST片段全序列的篩選、基因功能的檢測，使中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究實現(xiàn)與國際接軌。2002年以來，學科申報了4項發(fā)明專利。發(fā)表學術(shù)論文132篇，主編并出版31本教材，參加編寫并出版5本教材，專著14部，出版教學課件1件。產(chǎn)生了廣泛的學術(shù)影響。其中有1項科研成果實現(xiàn)轉(zhuǎn)讓。

在學術(shù)輻射方面，2002年以來，學科還通過加強承德、河南、天津、云南等中醫(yī)院校共建學科的建設(shè)，合作科學研究，聯(lián)合和接收研究生與青年教師培訓，共同舉辦了“全國辨證論治研討會”和全國師資進修班。此外，學科還主辦全國學術(shù)會議1次、地方學術(shù)會議2次，參加國際學術(shù)會議5次、專題境外學術(shù)交流3次、參加的全國學術(shù)會議多次。2004年，以本學科為核心和骨干，成立了上海中醫(yī)藥學會中醫(yī)基礎(chǔ)學分會，目前各項學術(shù)活動正積極開展。

在人才培養(yǎng)方面，2002年以來醫(yī)學教育|網(wǎng)搜集整理，學科在加強本學科青年教師培養(yǎng)的同時，在讀的博士后、博士生、碩士生共計89人，其中博士后4人、博士生29人、碩士生56人。學科開設(shè)課程23門（部分課程同時針對本科、研究生等不同層次學生講課），例如中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究、心身醫(yī)學概論、中醫(yī)學方法論、內(nèi)經(jīng)選讀、實驗中醫(yī)學、中醫(yī)學綜合實驗、分子生物學技術(shù)在中醫(yī)藥研究中的應用等。在課程建設(shè)方面，2002年以來，學科申報和中標包括教育部國家名牌課程建設(shè)“中醫(yī)學綜合實驗課程建設(shè)”項目等14項課程建設(shè)項目，發(fā)表教學研究論文8篇。學科在注重傳統(tǒng)教材的深化和完善的同時，順應中醫(yī)藥學術(shù)的發(fā)展，及時把科研成果轉(zhuǎn)化為教學形式，取得了積極的成果，學科建設(shè)期間獲得教學成果12項。其中包括2001-2004年度國家教學成果二等獎和上海市教學成果一等獎的“實驗中醫(yī)學課程建設(shè)”、2004年度上海市精品課程（實驗中醫(yī)學（含實驗中醫(yī)學、中醫(yī)學綜合實驗、分子生物學技術(shù)在中醫(yī)藥研究中的應用等3門課程））等。