山東中醫(yī)藥大學最好的專業(yè)：學校中醫(yī)基礎理論很強 ，針灸推拿、中醫(yī)、中藥方面的都不錯，中醫(yī)骨科、婦科、兒科、周圍血管、針灸推拿等專業(yè)都是好專業(yè)。

截至2014年5月，學校有3個博士后科研流動站，有3個博士學位授權一級學科、15個博士點；8個碩士學位授權一級學科、44個碩士點，碩士點涵蓋了中醫(yī)學、中西醫(yī)結合、醫(yī)學|教育網搜集整理中藥學全部二級學科，并開始向周邊學科滲透；擁有臨床醫(yī)學博士專業(yè)學位授予權和臨床醫(yī)學、中藥學、藥學、生物醫(yī)學工程碩士專業(yè)學位授予權。學校有2個國家重點學科和1個國家級重點（培育）學科，省級重點學科14個，國家中醫(yī)藥管理局重點學科29個。